多发性肾囊肿和多囊肾在临床上并非是一种疾病，两者间有很多区别。但是由于对这两种囊肿性疾病的认识不足，导致相当多的人把这两种囊肿性疾病混为一谈。
实际上，区别这两个囊肿性疾病，并不困难——
1、病因病机方面：多囊肾是常染色遗传病，多发性肾囊肿可以是先天的（胚胎时期形成），也可是创伤、炎性、肿瘤等引起。
2、家族史：多囊肾家庭成员中有类似患者，多发肾囊肿患者家族中往往无类似患者。
3、囊内容物：多囊肾内为尿液，多发肾囊肿内是体液（似血浆），其中含红细胞等。
4、并发症及危害：多囊肾可出现血尿、高血压、浮肿、肾功能不全、尿毒症，多发性肾囊肿一般不会出现高血压、肾功不全等。
5、预防：多囊肾可以控制囊体发展消除症状，多发性肾囊肿控制或缩小囊体，较小者可消除。
肾囊肿是最常见的肾脏异常，任何年龄均可发生，但2/3以上的患者见于50岁以上中老年人，被认为是衰老的改变。肾囊肿常偶然被发现，很多患者系体检查出，大多数肾囊肿不引起任何症状。如引起腰部胀痛或尿频、尿急、尿痛、尿血等泌尿系感染时，一般囊肿均较大，直径在5cm以上。
肾囊肿的治疗需因人因病情而异，不可一概而论。因为肾囊肿发展慢，在无症状时不损害肾脏，对健康无危害，且患者发现时一般年龄较大，因此对于无症状的患者，即使囊肿较大也可不行治疗，而采取定期复查肾脏B超；如患者腰部疼痛、排尿异常系由于肾囊肿引起，且肾囊肿直径在5cm以上，可采取手术治疗，但容易复发等。
多囊肾多由先天遗传或后天失养，肾气受损，络脉不和致肾囊血水内聚的内脏囊类疾病。多囊肾是先天性的，但早期并无任何症状，有的病人在20-30岁出现症状，大多数在40-50岁时出现症状。根据医生的经验，症状出现的年龄越轻越不好。
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